Казалось бы, рутинная миссия по поимке хорька для Сакуры, Сикамару и Наруто оборачивается засадой таинственных ниндзя. Разлученный с товарищами, Наруто сталкивается с непостижимым — формой энергии, чужой для всего, что он знал о ча́кре, и с тайнами цивилизации, канувшей в Лету. Вернувшись к команде, он понимает: ему предстоит не простое спасение, а битва за судьбу всего мира, стоящего на пороге забытой угрозы.