Утконос Перри, неугомонный и полный страхов и переживаний, как и все обитатели планеты, однажды обнаруживает, что самый страшный его кошмар стал реальностью. В мультфильме “Финес и Ферб: Покорение Второго Измерения” Финес и Ферб узнают, что их любимый домашний утконос является тайным агентом под прикрытием, и его личность как резидента Пи раскрыта. Это застает всех врасплох, и впереди Перри и его верные друзья ожидают захватывающие, полные опасностей приключения. Им предстоит отправиться во Второе Измерение, где они столкнутся с коварным доктором Дуфеншмирцем.