В Японии будущего цивилизация рухнула из-за безудержного применения оборонительного оружия, оставив после себя дикие земли и пустыни. Человечество выжило, создав укрепленные города в разных частях страны и управляя собой, а также готовясь к оборонительному оружию, которое стало диким и неконтролируемым.

Тем временем бушует Ржавый ветер, который ржавеет все, включая органические вещества, и человечество страдает от ржавчины, которая постепенно разъедает и в конце концов убивает людей. Считается, что причиной Ржавого ветра являются споры грибов, и "Хранители грибов", семья, умеющая обращаться с грибами, подвергается преследованиям. Однако на самом деле именно грибы помогают если не вылечить ржавчину, то хотя бы уменьшить ее.

Мальчик-хранитель грибов, Акахоси Биско, который выращивает грибы в разных местах в качестве средства против ржавчины, не обращая внимания на общественное мнение, вызвал переполох, и за него даже назначили награду, широко известную как "гриб-людоед". Цель Биско - найти "пожиратель ржавчины", целебный гриб, переданный хранителями грибов.