В стране, подвергшейся разрушениям после окончания Второй Мировой войны, вспыхивает новая надежда. Появляется агентство, призванное бороться с экстремистскими угрозами и терроризмом в Тихоокеанском регионе Японии. Его сотрудники – не обычные люди, а ниндзя, обладающие уникальными навыками и преданностью своей задаче. Деятельность агентства приобретает репутацию беспрекословной эффективности и вскоре становится международно признанным. Штат агентства насчитывает двадцать тысяч отчаянных специалистов, готовых защищать свою страну от преступников, которые не знают границ. Среди них есть и те, кто ещё только мечтает о чести и славе, такой как семнадцатилетний Куро Кумогакурэ. Несмотря на то, что общество считает его неудачником, внутри Куро горит желание стать защитником своей родины. Его стремление присоединиться к агентству не знает границ. И удивительным образом, ученика старших классов принимают на полставки в это загадочное агентство. На его плечи ложится бремя обучения в школе и службы в агентстве, и все это для того, чтобы стать не просто специалистом, но настоящим героем. За пределами героических миссий, Куро также выполняет рутинные задачи. Именно эта постоянная занятость помогает ему понять, что он способен на большее, и преодолеть метку неудачника, наклеенную на него обществом. Теперь он начинает верить в себя и свои собственные силы, готовясь к невероятным испытаниям, которые ждут его в будущем.